哮喘、花粉熱(或過敏性鼻炎)和濕疹(或特異反應(yīng)性皮炎)經(jīng)常在個體身上同時發(fā)生,部分原因是它們具有共同的遺傳來源。為了鑒定這些共同的遺傳變異,研究者對具有至少一種以上上述廣泛過敏性疾病表型的個體進行了全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS;n = 360838)。最終,研究者發(fā)現(xiàn)136個獨立的風險變異(P<3×10-8),其中的73個尚未報道過,暗示了附近的132個基因可能與過敏性疾病有關(guān)。疾病特異性作用變異位點只檢測到6個,這也證實了大多數(shù)位點具有共有的風險因素。組織特異性遺傳和生物過程富集分析表明共有的風險變異影響了淋巴細胞介導(dǎo)的免疫。6個目標基因為藥物重新定位提供了機會,36個基因CpG甲基化可以作為獨立遺傳效應(yīng)影響轉(zhuǎn)錄。哮喘、花粉熱和濕疹因為共享大量遺傳風險變異,造成免疫相關(guān)基因表達失調(diào),最終產(chǎn)生了疾病的部分共存現(xiàn)象。
研究背景:
哮喘、花粉熱和濕疹三種過敏性疾病往往相伴而生,但是其致病的遺傳原因仍然不十分清楚。
研究對象:
從UK Biobank、1000G數(shù)據(jù)庫以及23andMe公司獲得的表型和基因型數(shù)據(jù)。
研究方法:
全基因組關(guān)聯(lián)分析
研究流程:
研究結(jié)果:
圖1、與過敏性疾病風險關(guān)聯(lián)的136個遺傳風險變異位點(P<3×10-8)
表1、新發(fā)現(xiàn)的相關(guān)位點舉例列表
圖2、6個疾病特異性作用變異位點(黃色三角)。例如,rs61816761[A] 等位基因變異在濕疹中是在花粉熱中的1.32倍。rs2228145(黑色三角)表明在三種疾病中等位基因頻率沒有變化。
圖3、過敏性風險變異影響的組織及生物過程
根據(jù)圖3可見,這些變異主要影響血液和肺中的基因表達,并且在胞外信號誘導(dǎo)自噬的生物過程得到富集。
表2、潛在可行的過敏性疾病藥物及目標基因列表
根據(jù)本研究結(jié)果,研究者發(fā)現(xiàn)了29個基因可能用于后續(xù)靶向藥物開發(fā),這些可能用于過敏性疾病治療(表2),為藥物重新定位提供理論支持。
結(jié)論: