葉綠體基因組研究連登Int J Mol Sci雜志（IF = 4.183）

發(fā)稿時(shí)間：2019-09-16來源：天昊生物

摘要：葉綠體隨機(jī)測(cè)序最新研究進(jìn)展

1、題目：Comparative Analysis of two Sugarcane Ancestors Saccharum officinarum and S. spontaneum based on Complete Chloroplast Genome Sequences and Photosynthetic Ability in Cold Stress（基于葉綠體基因組序列和低溫脅迫下光合能力的祖先甘蔗Saccharum officinarum和S. spontaneum的比較分析）

發(fā)表時(shí)間：2019年8月

多倍體甘蔗復(fù)雜的核基因組阻礙了甘蔗的改良進(jìn)程。相比之下，葉綠體基因組則更小更簡單，除了是植物光合作用的場(chǎng)所，它在進(jìn)化過程中還發(fā)展出了其他功能，如應(yīng)對(duì)環(huán)境壓力的耐受性。本研究對(duì)甘蔗兩個(gè)祖先種Saccharum officinarum和S. spontaneum的葉綠體基因組進(jìn)行了二代隨機(jī)測(cè)序，并對(duì)這兩個(gè)種的基因組和光合能力進(jìn)行了比較分析，實(shí)驗(yàn)結(jié)果為甘蔗葉綠體的生物學(xué)機(jī)制及系統(tǒng)發(fā)育和進(jìn)化研究奠定了基礎(chǔ)，有助于現(xiàn)代甘蔗光合能力和抗寒性的遺傳改良。

甘蔗Saccharum officinarum和S. spontaneum的葉綠體基因組圈圖

兩個(gè)甘蔗葉綠體基因組的共線分析

2、題目：Cuscuta Species Identification Based on the Morphology of Reproductive Organs and Complete Chloroplast Genome Sequences（基于繁殖器官形態(tài)和葉綠體基因組序列的菟絲子物種鑒定）

發(fā)表時(shí)間：2019年6月

Cuscuta Species Identification Based on theMorphology of Reproductive Organs and Complete Chloroplast Genome Sequences

菟絲子屬(旋花科)包含有眾所周知的寄生植物，會(huì)造成大面積的作物損失。此外，其種子可以入藥。盡管菟絲子屬物種很重要，但用肉眼很難區(qū)分這些植物。在本研究利用繁殖殖器官的形態(tài)特征和葉綠體基因組的分子特征來區(qū)分C. chinensis和C. japonica。葉綠體基因組的分析揭示了兩種植物葉綠體基因組長度和基因順序的巨大差異。盡管兩種植物都表現(xiàn)出大量的葉綠體基因缺失和基因組重排，但在亞屬中表現(xiàn)出高度相似的結(jié)構(gòu)。本研究結(jié)果為菟絲子的分類、系統(tǒng)發(fā)育和進(jìn)化分析以及中草藥的準(zhǔn)確鑒定提供了有用的信息。

七種菟絲子的線性葉綠體基因組圖譜比較

菟絲子屬和甘薯屬的系統(tǒng)發(fā)育分析

3、題目：The Complete Chloroplast Genomes of Punica granatum and a Comparison with Other Species in Lythraceae（石榴葉綠體完整基因組及其與千屈菜科其他植物的比較）

發(fā)表時(shí)間：2019年6月

石榴是干旱半干旱熱帶和亞熱帶地區(qū)最受歡迎的果樹之一。在本研究中，研究者鑒定了不同表型石榴品種的三個(gè)完整葉綠體基因組。之后結(jié)合以前的兩個(gè)報(bào)道分析了石榴葉綠體基因組的序列多樣性。結(jié)果表明，該序列多樣性極低，未檢測(cè)到信息位點(diǎn)，表明葉綠體基因組序列可能不適合研究石榴基因型的遺傳多樣性。此外，本研究分析了密碼子使用模式，并確定了潛在的核糖核酸編輯位點(diǎn)。與千屈菜科其他物種的葉綠體基因組比較分析顯示，基因含量和組織高度保守。基于位點(diǎn)特異性模型，共檢測(cè)出11個(gè)位點(diǎn)選擇積極的基因，其中大部分是光合作用相關(guān)基因和遺傳系統(tǒng)相關(guān)基因。根據(jù)完整的葉綠體基因組確定了石榴的分類位置。系統(tǒng)發(fā)育分析表明，石榴與千屈菜科其他物種形成單枝，具有較高的支持價(jià)值，其完整的葉綠體基因組為了解系統(tǒng)發(fā)育位置提供了有價(jià)值的信息。

千屈菜科五個(gè)葉綠體基因組的共線性分析

關(guān)于天昊

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